RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 SDHAP31040 664 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 MVKQ03426 396 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RRM2BQ7LG56 351 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SYT4Q9H2B2 425 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GORASP2Q9H8Y8 452 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 IL20RAQ9UHF4 553 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 WIPI2Q9Y4P8 454 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ATP8B1O43520 1251 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SPRY3O43610 288 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 MT-ND5P03915 603 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TEKQ02763 1124 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 PSG7Q13046 419 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 FGD3Q5JSP0 725 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 RFLNBQ8N5W9 214 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF665Q9H7R5 613 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 G6PC2Q9NQR9 355 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 DECR2Q9NUI1 292 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 XKRYO14609 159 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 MPZL1O95297 269 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TXNDC12O95881 172 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 SCRN3Q0VDG4 424 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 GPR139Q6DWJ6 353 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 OR51F2Q8NH61 342 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ELOVL3Q9HB03 270 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 TBCCD1Q9NVR7 557 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 ADA2Q9NZK5 511 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB3-211ENST00000490677 DOK2O60496 412 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV2-5P01817 119 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CD55P08174 381 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 HSD17B1P14061 328 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 PCMT1P22061 227 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 SRP14P37108 136 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 SLC7A6Q92536 515 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ELMOD3Q96FG2 381 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 MSL2Q9HCI7 577 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CYSLTR2Q9NS75 346 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CD300AQ9UGN4 299 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 OR6C6A6NF89 314 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN25C9JDP6 229 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 DCTN6O00399 190 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 SOCS2O14508 198 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 SGCEO43556 437 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 SLC16A7O60669 478 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 AVPP01185 164 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 LIPAP38571 399 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 HTR5AP47898 357 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 LSM6P62312 80 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 AQP6Q13520 282 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 KCNMB1Q16558 191 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 HFEQ30201 348 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ZER1Q7Z7L7 766 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 OR52J3Q8NH60 311 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 NUAK2Q9H093 628 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 FAM107BQ9H098 131 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 TRAV20A0A0B4J274 112 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 PLSCR5A0PG75 271 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD16AO95870 558 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 RBMXP38159 391 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CDK5R2Q13319 367 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 Q6ZR03 302 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ADCK1Q86TW2 530 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 GLB1L2Q8IW92 636 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 DCAF16Q9NXF7 216 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ASH2LQ9UBL3 628 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 STARD10Q9Y365 291 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 V9GYQ6 96 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 UNC119BA6NIH7 251 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 GPANK1O95872 356 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ITGA2P17301 1181 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGDIAP52565 204 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 MTX3Q5HYI7 312 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 NPEPL1Q8NDH3 523 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 CCL17Q92583 94 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 PYURFQ96I23 114 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 TSSK2Q96PF2 358 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 NDEL1Q9GZM8 345 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 TENM1Q9UKZ4 2725 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 TCF21O43680 179 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 PLPP2O43688 288 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms