RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	GLO1	Q04760	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		Q0VFX4	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	INSL4	Q14641	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR7A5	Q15622	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		R4GN57	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DMD	P11532	3685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		H7C1C5	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR171	O14626	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PIN1P1	O15428	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC16A7	O60669	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFPL1	O95159	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	APOA1	P02647	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ISG15	P05161	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OCM2	P0CE71	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PGA4	P0DJD7	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PSKH1	P11801	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NR2C1	P13056	603 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	IL7	P13232	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TCN2	P20062	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB3B	P20337	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NPR2	P20594	1047 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	EDNRA	P25101	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CTSS	P25774	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DPP4	P27487	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MNDA	P41218	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NR4A2	P43354	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	BCAP31	P51572	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HCCS	P53701	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX8	P57073	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFA1	P59665	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFA3	P59666	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LCN6	P62502	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35A1	P78382	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MXD1	Q05195	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ASAH1	Q13510	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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