RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512554.1

GCSHP1-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP1, Length 484 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP1-201ENST00000512554 TSSK2Q96PF2 358 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 OR2M2Q96R28 347 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 INTS14Q96SY0 518 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 MED18Q9BUE0 208 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 MED29Q9NX70 200 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GLTPQ9NZD2 209 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 STUB1Q9UNE7 303 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 COPS3Q9UNS2 423 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CACNA1CQ13936 2221 aa6.64□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 METTL15A6NJ78 407 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF726A6NNF4 738 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 AIREO43918 545 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CXCL13O43927 109 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GPRIN2O60269 458 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 SELENOFO60613 162 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC16A7O60669 478 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TMEM127O75204 238 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 UPK3AO75631 287 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GPX5O75715 221 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 F10P00742 488 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 HLA-DPB1P04440 258 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TACSTD2P09758 323 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 KLK2P20151 261 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PCSK6P29122 969 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PYCR1P32322 319 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 STARP49675 285 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ENTPD1P49961 510 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CLDN17P56750 224 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 SIRPAP78324 504 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PLGLB1Q02325 96 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GTF3C1Q12789 2109 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 MELKQ14680 651 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GUSBP1Q15486 140 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 USP43Q70EL4 1123 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 SSX6Q7RTT6 188 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ST7LQ8TDW4 575 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 UFD1Q92890 307 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 MCHR2Q969V1 340 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 SMIM19Q96E16 107 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PELI1Q96FA3 418 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GLRX2Q9NS18 164 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.63□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 PRR32B1ATL7 298 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 H0YC42 278 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 H7C1C5 153 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 DHHO43323 396 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TMCC2O75069 709 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 APOL3O95236 402 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 IL1AP01583 271 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 HPXP02790 462 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 GADD45AP24522 165 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CD79BP40259 229 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TMPRSS3P57727 454 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 OR12D2P58182 307 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 LCN6P62502 163 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 CDK5R1Q15078 307 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 ETFDHQ16134 617 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 TBR1Q16650 682 aa6.62□□□□□ -1.35
GCSHP1-201ENST00000512554 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.62□□□□□ -1.35
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