RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ASPHD2Q6ICH7 369 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR6M1Q8NGM8 313 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CLDN23Q96B33 292 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MED29Q9NX70 200 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 U3KQA8 63 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MEIKINA0A087WXM9 373 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TMEM212A6NML5 194 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SIGLEC6O43699 453 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ALOX12BO75342 701 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SCRG1O75711 98 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 DCTDP32321 178 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FOXK1P85037 733 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SQSTM1Q13501 440 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ABHD6Q9BV23 337 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 PRO3102Q9H379 93 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ARID1AO14497 2285 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 G3V3Q6 166 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 H3BML4 177 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 M0R233 179 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EFNA2O43921 213 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 KRT33AO76009 404 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 IFNGR1P15260 489 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R20P59543 309 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN5P62079 268 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 DYRK1AQ13627 763 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZTK2 550 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 KRT77Q7Z794 578 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 BIVMQ86UB2 503 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR11G2Q8NGC1 345 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MCHR2Q969V1 340 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MIB2Q96AX9 1013 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 HAVCR1Q96D42 359 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 NXPE2Q96DL1 559 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CMTM3Q96MX0 182 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 GABARAPH6UMI1 98 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CALCBP10092 127 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EMP2P54851 167 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SLC26A5P58743 744 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 RAB14P61106 215 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FOXF1Q12946 379 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A25Q6KCM7 469 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 STK35Q8TDR2 534 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GVI7 797 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 TOR1AO14656 332 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 RNF128Q8TEB7 428 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 HGDQ93099 445 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 MNTQ99583 582 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 EMC6Q9BV81 110 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 AUP1Q9Y679 476 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-213ENST00000492657 KDM4BO94953 1096 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 IFNA7P01567 189 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ITGA5P08648 1049 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NAT2P11245 290 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 BLVRAP53004 296 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms