RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 A0A087WUJ7 227 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 CD74P04233 296 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 INHAP05111 366 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 CEACAM5P06731 702 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 MAP3K8P41279 467 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 F2RL1P55085 397 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 SPOCK1Q08629 439 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 MYO15AQ9UKN7 3530 aa16.09■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 CXCL10P02778 98 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 FAM157CP0CG43 387 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 ALOX5APP20292 161 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 CCR4P51679 360 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 PMPCAQ10713 525 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 SMCO1Q147U7 214 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 ASB13Q8WXK3 278 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 ZNF524Q96C55 264 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 OR2A5Q96R48 311 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 RHOFQ9HBH0 211 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.08■□□□□ 0.17
PREB-208ENST00000468045 TMEM212A6NML5 194 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 H0YIZ8 118 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 HLA-DQA2P01906 255 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ZNF44P15621 663 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SERPINF1P36955 418 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ADAM8P78325 824 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SREBF2Q12772 1141 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ELOCQ15369 112 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 MEP1BQ16820 701 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 EDAQ92838 391 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 LRFN5Q96NI6 719 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 EDEM2Q9BV94 578 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SEC11CQ9BY50 192 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 GHRLQ9UBU3 117 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 WIPF3A6NGB9 483 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 GPR75O95800 540 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 TPT1P13693 172 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 CD1CP29017 333 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ALG10Q5BKT4 473 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 MISPQ8IVT2 679 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 JAGN1Q8N5M9 183 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 STOML3Q8TAV4 291 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 RNF141Q8WVD5 230 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SUSD6Q92537 303 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 RNF126Q9BV68 326 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.08■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 LMX1BO60663 402 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 CSTAP01040 98 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 MELTFP08582 738 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SFTA3P0C7M3 94 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 RNF224P0DH78 156 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 PTAFRP25105 342 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ADH6P28332 368 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 MESTQ5EB52 335 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ISOC2Q96AB3 205 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 TMEM100Q9NV29 134 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ADH1AP07327 375 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SELLP14151 372 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 PSMB6P28072 239 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 LSSP48449 732 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 GPR143P51810 404 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 ECH1Q13011 328 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SLC25A42Q86VD7 318 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 RCBTB1Q8NDN9 531 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 FAM46BQ96A09 425 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 KXD1Q9BQD3 176 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 MMP26Q9NRE1 261 aa16.07■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 TMEM127O75204 238 aa16.06■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 NKX2-2O95096 273 aa16.06■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 S100A6P06703 90 aa16.06■□□□□ 0.16
PREB-208ENST00000468045 SMIM10L1P0DMW3 83 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms