RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 DNASE1L1P49184 302 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 SPOCK1Q08629 439 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 TDGQ13569 410 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 CLLU1Q5K131 121 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 STK35Q8TDR2 534 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ARL5BQ96KC2 179 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 FOXQ1Q9C009 403 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 VDAC3Q9Y277 283 aa15.2■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR2M5A3KFT3 312 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 NPIPA5E9PKD4 350 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.19■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.19■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 TMEM234Q8WY98 164 aa15.19■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 NPIPA1Q9UND3 350 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 MS4A18H0YCH9 400 aa15.19■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 MS4A18Q3C1V0 323 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 STEAP1BQ6NZ63 245 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 TMEM205Q6UW68 189 aa15.19■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A28Q96A46 364 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR2A7Q96R45 310 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 MED11Q9P086 117 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 AUP1Q9Y679 476 aa15.19■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PPC1 479 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 GLB1P16278 677 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 MAP2K6P52564 334 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.18■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 CHST6Q9GZX3 395 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 CENPMQ9NSP4 180 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 MED29Q9NX70 200 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 R4GMQ9 66 aa15.18■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.18■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ARPC5O15511 151 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 MBTPS2O43462 519 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 LMX1BO60663 402 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 RGS11O94810 467 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ZNF35P13682 527 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 OR10K2Q6IF99 312 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 C11orf88Q6PI97 169 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ARSKQ6UWY0 536 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A45Q8N413 288 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 STT3BQ8TCJ2 826 aa15.17■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 HHLA2Q9UM44 414 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.17■□□□□ 0.02
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ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PPL8 197 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 H3BML4 177 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 DHODHQ02127 395 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 COL19A1Q14993 1142 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 CARFQ8N187 725 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 GABRG1Q8N1C3 465 aa15.17■□□□□ 0.02
ACTB-207ENST00000462494 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.17■□□□□ 0.02
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