RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384040.1

RNU6-949P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 949, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-949P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-949P-201ENST00000384040 OPRD1P41143 372 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ATP1B3P54709 279 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CCNA1P78396 465 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CDK16Q00536 496 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 IL5RAQ01344 420 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZNF92Q03936 586 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C2orf54Q08AI8 447 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 PJVKQ0ZLH3 352 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C1orf61Q13536 156 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RCAN2Q14206 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 YIF1BQ5BJH7 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C10orf120Q5SQS8 335 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C1orf220Q5T0J3 134 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TCF24Q7RTU0 167 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 PEX26Q7Z412 305 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ECHDC2Q86YB7 292 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 EGFL6Q8IUX8 553 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FAM133AQ8N9E0 248 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR1F12Q8NHA8 337 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ACTL9Q8TC94 416 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MAIP1Q8WWC4 291 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TMEM186Q96B77 213 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CABS1Q96KC9 395 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GPR82Q96P67 336 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MS4A4EQ96PG1 132 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SORT1Q99523 831 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TCHPQ9BT92 498 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FAIM2Q9BWQ8 316 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GGTLC1Q9BX51 225 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ABCG5Q9H222 651 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SPASTQ9UBP0 616 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MGAT4BQ9UQ53 548 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MEMO1Q9Y316 297 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OTOFQ9HC10 1997 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZNF860A6NHJ4 632 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR5H1A6NKK0 313 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 D6RAR5 112 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 F6UB75 175 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C15orf65H3BRN8 121 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 HAS3O00219 553 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SLC22A5O76082 557 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GLSO94925 669 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DIRAS1O95057 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 AIFM1O95831 613 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 TGFAP01135 160 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 IGHV3-11P01762 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 IGHV2-5P01817 119 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CD3GP09693 182 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ETS1P14921 441 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RAB3BP20337 219 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CD1CP29017 333 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GNA11P29992 359 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CEACAM3P40198 252 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CDKN2DP55273 166 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CBX3Q13185 183 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 CEBPEQ15744 281 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SP6Q3SY56 376 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 AVPI1Q5T686 147 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 RAET1GQ6H3X3 334 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 DEGS2Q6QHC5 323 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 FAM131AQ6UXB0 335 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 LINC00469Q8N7U9 141 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 OR2G2Q8NGZ5 317 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 UBE2E3Q969T4 207 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 NTAN1Q96AB6 310 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 MRGPRFQ96AM1 343 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 C7orf34Q96L11 122 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-949P-201ENST00000384040 SAMD8Q96LT4 415 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms