RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM129	A0AVI4	362 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	PHYH	O14832	338 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TMCC2	O75069	709 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	MYL12A	P19105	171 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NPR2	P20594	1047 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	AGA	P20933	346 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	AGTR1	P30556	359 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	PYCR1	P32322	319 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR3A2	P47893	321 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF84	P51523	738 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	GALE	Q14376	348 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NEDD8	Q15843	81 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF649	Q9BS31	505 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	FREM3	P0C091	2139 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CLDN14	O95500	239 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	IL2RA	P01589	272 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	TF	P02787	698 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	MT-ND2	P03891	347 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	LIMS3	P0CW19	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	LIMS4	P0CW20	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	GAA	P10253	952 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	COX6B1	P14854	86 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	FMOD	Q06828	376 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ACSM1	Q08AH1	577 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RAB39A	Q14964	217 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ETFDH	Q16134	617 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CDC20B	Q86Y33	519 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	SGCD	Q92629	289 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	RORB	Q92753	470 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	BOD1	Q96IK1	185 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	INTS14	Q96SY0	518 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	WDR76	Q9H967	626 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	MALT1	Q9UDY8	824 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CELF4-222	ENST00000601392	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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