RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556082.5

ATXN3-235, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-235ENST00000556082 CD82P27701 267 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 SRD5A2P31213 254 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 THBS2P35442 1172 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF79Q15937 498 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 CEP78Q5JTW2 689 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 ACER2Q5QJU3 275 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 RAB43Q86YS6 212 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 UEVLDQ8IX04 471 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 FAM168AQ92567 244 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 C5orf34Q96MH7 638 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 RBP7Q96R05 134 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 MRI1Q9BV20 369 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 RASD1Q9Y272 281 aa7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
ATXN3-235ENST00000556082 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 H3BML4 177 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 SULT2B1O00204 365 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 DVL2O14641 736 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 MAGEB3O15480 346 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 RAD1O60671 282 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 PFDN1O60925 122 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 TMCC2O75069 709 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 P04436 131 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 NR2C1P13056 603 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 SRMP19623 302 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 RAB3BP20337 219 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 NPR2P20594 1047 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 DCTDP32321 178 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 DLSTP36957 453 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 PSMB10P40306 273 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 CYB561P49447 251 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 PSMD7P51665 324 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 CAV3P56539 151 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 OR2B6P58173 313 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 KCNMB1Q16558 191 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 HIST3H3Q16695 136 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 Q499Y3 187 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 CCDC157Q569K6 752 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 HES3Q5TGS1 186 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF544Q6NX49 715 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 KDM8Q8N371 416 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 RNF128Q8TEB7 428 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 THEM6Q8WUY1 208 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 NSMAFQ92636 917 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 TXNDC15Q96J42 360 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 C4orf45Q96LM5 186 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 GNRHR2Q96P88 292 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 DERL3Q96Q80 235 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 OR5B2Q96R09 309 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 PIGQQ9BRB3 760 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 ABHD6Q9BV23 337 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.39□□□□□ -1.23
ATXN3-235ENST00000556082 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.4 ms