RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	PTH	P01270	115 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF32	P17041	273 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	MSR1	P21757	451 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PTH2R	P49190	550 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	DAG1	Q14118	895 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FAM27B	Q5VT28	67 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ASRGL1	Q7L266	308 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FBXO17	Q96EF6	278 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF75A	Q96N20	296 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	EMC7	Q9NPA0	242 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	IL20	Q9NYY1	176 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZFHX3	Q15911	3703 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		15.38	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902		H3BN98	237 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TMCC2	O75069	709 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CD8A	P01732	235 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CST2	P09228	141 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CCL2	P13500	99 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PRKACG	P22612	351 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CRABP1	P29762	137 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ATP5J2	P56134	94 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	RIPPLY3	P57055	190 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PCBD1	P61457	104 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	HGFAC	Q04756	655 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CCNI	Q14094	377 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	DTX2	Q86UW9	622 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TSSK2	Q96PF2	358 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CDH20	Q9HBT6	801 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	POLE4	Q9NR33	117 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	AP4S1	Q9Y587	144 aa		15.37	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR4A8	P0C604	315 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	BMP4	P12644	408 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CCNO	P22674	350 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	POU1F1	P28069	291 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	APLNR	P35414	380 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	THBS4	P35443	961 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SERPINF1	P36955	418 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	COX10	Q12887	443 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902		Q5PR19	223 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OTP	Q5XKR4	325 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	NUP37	Q8NFH4	326 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	GSX2	Q9BZM3	304 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR51B6	Q9H340	312 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	C1orf198	Q9H425	327 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FN3K	Q9H479	309 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		15.36	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OVOL3	O00110	214 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	BHLHE40	O14503	412 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	MPZL1	O95297	269 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SCG5	P05408	212 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF35	P13682	527 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	NR4A1	P22736	598 aa		15.35	■□□□□ 0.05

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