RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRK2Q5S007 2527 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PPL8 197 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS44E7EML9 344 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 E9PQ18 207 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 AHCYL1O43865 530 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 GPANK1O95872 356 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SCG5P05408 212 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 GYPBP06028 91 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 CLUP10909 449 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 B4GALT1P15291 398 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF3P17036 446 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 COX5AP20674 150 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 IL32P24001 234 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 CCKARP32238 428 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 GGT2P36268 569 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT2B10P36537 528 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF84P51523 738 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 AQP4P55087 323 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBA1BP68363 451 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBA4AP68366 448 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 STK11Q15831 433 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 GABRA6Q16445 453 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SGCAQ16586 387 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 C10orf128Q5T292 105 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 OTPQ5XKR4 325 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBA1AQ71U36 451 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 CPOQ8IVL8 374 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 OR6V1Q8N148 313 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC01560Q8TB33 94 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 FNDC8Q8TC99 324 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 CYGBQ8WWM9 190 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PTP4A1Q93096 173 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 S100PBPQ96BU1 408 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX18Q96RF0 628 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXB1Q99853 325 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX12Q9BXU0 123 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 NELFAQ9H3P2 528 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 RTTNQ86VV8 2226 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SH3D21A4FU49 640 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TVP23AA6NH52 213 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 MPZL1O95297 269 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 CLIC3O95833 236 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 NR2C1P13056 603 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 LAP3P28838 519 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 CRABP1P29762 137 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PCYT1AP49585 367 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 EFNB1P98172 346 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TGFBR3Q03167 851 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC18Q8N456 261 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR31Q8NA23 367 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52N5Q8NH56 324 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM163Q8TC26 289 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 RDH12Q96NR8 316 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 MUS81Q96NY9 551 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 PITX2Q99697 317 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD28-208ENST00000463533 SH3GL3Q99963 347 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms