RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPB6O14558 160 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS11O94810 467 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TBXA2RP21731 343 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IL11RAQ14626 422 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPB2Q16082 182 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 BCO1Q9HAY6 547 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LANCL2Q9NS86 450 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TOR1AO14656 332 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX19O60806 448 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR35P0CG20 571 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CD53P19397 219 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LAP3P28838 519 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SNCAP37840 140 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF546Q86UE3 836 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF170Q96K19 258 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TSSK2Q96PF2 358 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SOD1P00441 154 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DRD3P35462 400 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM99Q8N816 258 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MBOAT4Q96T53 435 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF728P0DKX0 622 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ARR3P36575 388 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ECI1P42126 302 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8B8Q15620 311 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 BOD1Q96IK1 185 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 S1PR5Q9H228 398 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNA10P01566 189 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.033e-7■■■□□ 15.5
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2L13Q8N349 312 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS37A4D1T9 235 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 STMND1H3BQB6 276 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SHOXO15266 292 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SPINT2O43291 252 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNB1P11230 501 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RBP2P50120 134 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 COMTD1Q86VU5 262 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCA3Q99758 1704 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPV4 95 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PPM1DO15297 605 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 STK17BO94768 372 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CD79BP40259 229 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ETV1P50549 477 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF92Q03936 586 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSM1Q08AH1 577 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PMPCAQ10713 525 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP21Q9H596 190 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 GCM1Q9NP62 436 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PROCRQ9UNN8 238 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R135 149 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 MYF5P13349 255 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF799Q96GE5 643 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KIRREL1Q96J84 757 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPH5 198 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 F8W036 122 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 LILRB5O75023 590 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 EDDM3BP56851 147 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ESCO2Q56NI9 601 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSFQ9UBX1 484 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF732B4DXR9 585 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CALCBP10092 127 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF136P52737 540 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN15P56746 228 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 NXPH1P58417 271 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FAHD1Q6P587 224 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 COMMD7Q86VX2 200 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms