RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312777.9

TCHP-201, Transcript of trichoplein keratin filament binding, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TCHP, Length 3,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHP-201ENST00000312777 ZNF585AQ6P3V2 769 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 GJD3Q8N144 294 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PPP1R14AQ96A00 147 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 URADA6NGE7 173 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 MCIDASD6RGH6 385 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 EMC8O43402 210 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 VEGFDO43915 354 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 CTAG2O75638 210 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 FBP1P09467 338 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 GJA4P35212 333 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 CASP6P55212 293 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PPP1R1AQ13522 171 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SLC22A6Q4U2R8 563 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RAB42Q8N4Z0 105 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ZNF676Q8N7Q3 588 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ACOT4Q8N9L9 421 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ELOA3Q8NG57 546 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 OR7G2Q8NG99 324 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 TMEM106AQ96A25 262 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SGK3Q96BR1 496 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 FN3KRPQ9HA64 309 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SERGEFQ9UGK8 458 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.06□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SEC16AO15027 2179 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 MSGN1A6NI15 193 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ZNF749O43361 778 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RAB2AP61019 212 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PGAP1Q75T13 922 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 BAP18Q8IXM2 172 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 BPIFB2Q8N4F0 458 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 CCDC107Q8WV48 283 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 KXD1Q9BQD3 176 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SULT4A1Q9BR01 284 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SEC11CQ9BY50 192 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 GPR34Q9UPC5 381 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 XRCC3O43542 346 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 MED6O75586 246 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PMS2P2O95744 297 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ACTA2P62736 377 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ACTG2P63267 376 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RUNX3Q13761 415 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ZNF227Q86WZ6 799 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SLAMF9Q96A28 289 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SLC6A7Q99884 636 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 CST11Q9H112 138 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 CALML5Q9NZT1 146 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 TMED7Q9Y3B3 224 aa10.05□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 H7C1Q1 480 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 LRP3O75074 770 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 IFNGP01579 166 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 NGFRP08138 427 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 OR2T7P0C7T2 308 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RAB6AP20340 208 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PRKAR1BP31321 381 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 DRD3P35462 400 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 LSSP48449 732 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 MPPED2Q15777 294 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RNF212Q495C1 297 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 OR2L13Q8N349 312 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 EID2Q8N6I1 236 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 OR2T27Q8NH04 317 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 OR5AK2Q8NH90 309 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 RNF141Q8WVD5 230 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 A0A087WV62 115 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 A0A1W2PPE2 198 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 SNAPC5O75971 98 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 PMP2P02689 132 aa10.04□□□□□ -0.8
TCHP-201ENST00000312777 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms