RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	YDR514C	Q04408	483 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	OSW1	Q08692	278 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	HAL9	Q12180	1030 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		2.42	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	RAD4	P14736	754 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.41	□□□□□ -2.02	not detected
YJL135W	YJL135W	DAL7	P21826	554 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	ERT1	P38140	529 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	PAC2	P39937	518 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	FMP52	P40008	231 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	GYP8	P43570	497 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	SSY5	P47002	699 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	TAD1	P53065	400 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.41	□□□□□ -2.02	not detected
YJL135W	YJL135W	NRG1	Q03125	231 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	UBX5	Q06682	500 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	FLC1	Q08967	793 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YJL135W	YJL135W	CAN1	P04817	590 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TOP3	P13099	656 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	SPC29	P33419	253 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YBR284W	P38150	797 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	HOS4	P40480	1083 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	PFA3	P42836	336 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	NNF1	P47149	201 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	UBC11	P52492	156 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TEL2	P53038	688 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ZIP2	P53061	704 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	RSC3	Q06639	885 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	PRC1	P00729	532 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	GAL11	P19659	1081 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MTC2	P34246	357 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	BET3	P36149	193 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.39	□□□□□ -2.03	not detected
YJL135W	YJL135W	GID8	P40208	455 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	XBP1	P40489	647 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TY4A-J	P47023	414 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YGR125W	P53273	1036 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YPL068C	Q02749	293 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	COG8	Q04632	607 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	NSE3	Q05541	303 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MCM21	Q06675	368 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	IRC13	Q08630	104 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MET7	Q08645	548 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YOR022C	Q12204	715 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	PER1	P25625	357 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	SAK1	P38990	1142 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TIM54	P47045	478 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	BNA2	P47125	453 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MRK1	P50873	501 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TGL5	Q12043	749 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	DIF1	O13577	133 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YCL002C	P25565	263 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	HIR1	P32479	840 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YEL1	P34225	687 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	BCD1	P38772	366 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	REV7	P38927	245 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	GDH3	P39708	457 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	CAF16	P43569	289 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	RTA1	P53047	317 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	HUL5	P53119	910 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ARG5,6	Q01217	863 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	RPN4	Q03465	531 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	GAD1	Q04792	585 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MDM12	Q92328	271 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	SAP190	P36123	1033 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	BDH2	P39713	417 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ARG2	P40360	574 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	NDC80	P40460	691 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MAL11	P53048	616 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	YBP2	P53169	641 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	FHN1	P53279	174 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	GEP3	Q08622	556 aa		2.36	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ERG11	P10614	530 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	MCD4	P36051	919 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	APT2	P36973	181 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	ATG4	P53867	494 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	REC102	Q02721	264 aa		2.35	□□□□□ -2.03
YJL135W	YJL135W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	2.35	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms