RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636566.1

EFHC1-222, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-222	ENST00000636566	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM163B	P0C2L3	166 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TNNT1	P13805	278 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ABCD1	P33897	745 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	EVA1C	P58658	441 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	LNPK	Q9C0E8	428 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	MAF1	Q9H063	256 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SLAIN2	Q9P270	581 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	NFAT5	O94916	1531 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SLIT3	O75094	1523 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566		A0A1B0GUL7	405 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566		F6X3S4	739 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	BRD1	O95696	1058 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	GNAI3	P08754	354 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	FLII	Q13045	1269 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	BRINP3	Q76B58	766 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	G2E3	Q7L622	706 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SMC5	Q8IY18	1101 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	MICALL2	Q8IY33	904 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ATL2	Q8NHH9	583 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TMX1	Q9H3N1	280 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	DEF6	Q9H4E7	631 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	APBB1	O00213	710 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	GNAI2	P04899	355 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	HOXB7	P09629	217 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CYP2C19	P33261	490 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	MAGEA8	P43361	318 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	NUCB1	Q02818	461 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SYCP1	Q15431	976 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF280D	Q6N043	979 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CCDC125	Q86Z20	511 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TATDN2	Q93075	761 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TOMM22	Q9NS69	142 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SKIL	P12757	684 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CABP4	P57796	275 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	RHBDL3	P58872	404 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	MCTP2	Q6DN12	878 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	GPR153	Q6NV75	609 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	STRN4	Q9NRL3	753 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ATG3	Q9NT62	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ETAA1	Q9NY74	926 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	NCAPD2	Q15021	1401 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	CCP110	O43303	1012 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	KCNQ3	O43525	872 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	PPFIA2	O75334	1257 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	ERCC3	P19447	782 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-222	ENST00000636566	GYS2	P54840	703 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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