RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585236.5

TSPOAP1-AS1-211, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SNX14Q9Y5W7 946 aa31.9■■■□□ 2.7
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.72■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 AMIGO3Q86WK7 504 aa31.71■■■□□ 2.67
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NYXQ9GZU5 481 aa31.71■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZAP70P43403 619 aa31.71■■■□□ 2.67
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SETDB2Q96T68 719 aa31.71■■■□□ 2.67
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