RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 TNNI3KQ59H18 835 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 AACSQ86V21 672 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 NPR1P16066 1061 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 GPATCH3Q96I76 525 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF609O15014 1411 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 MX1P20591 662 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 AOX1Q06278 1338 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-202ENST00000570641 SRGNP10124 158 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 PDE1AP54750 535 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 MASTLQ96GX5 879 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 STAP2Q9UGK3 403 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 H0YIN7 160 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 BBOX1O75936 387 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 PDE8BO95263 885 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 TMC4Q7Z404 712 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 CACNA1SQ13698 1873 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 ALDH1B1P30837 517 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 CHRNDQ07001 517 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 ATP2B3Q16720 1220 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 A0A1B0GUL7 405 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 STYK1Q6J9G0 422 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 ERC2O15083 957 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 TIMM10P62072 90 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 TTC22Q5TAA0 569 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 LPIN2Q92539 896 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-202ENST00000570641 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 SLC5A1P13866 664 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 FGFR2P21802 821 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 TAF5LO75529 589 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 UBE4AQ14139 1066 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 CNKSR1Q969H4 720 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 AK9Q5TCS8 1911 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 GORABQ5T7V8 394 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 XAGE2Q96GT9 111 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 CHRNA5P30532 468 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 KCNJ4P48050 445 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 SP8Q8IXZ3 490 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 SPON1Q9HCB6 807 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 XDHP47989 1333 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 ATP5JP18859 108 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 TGFB2P61812 414 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 SLX4Q8IY92 1834 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 ADORA1P30542 326 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 PTGER2P43116 358 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS2-202ENST00000570641 ATP2B4P23634 1241 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 LTBP1Q14766 1721 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 DPEP1P16444 411 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 GPSM2P81274 684 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 SNAP23O00161 211 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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