RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.34■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 RPS8P62241 208 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 GPR108Q9NPR9 543 aa29.33■■■□□ 2.29
MEIS3-204ENST00000558555 TNNI3KQ59H18 835 aa29.32■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.32■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.32■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 MX1P20591 662 aa29.31■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 GRAPQ13588 217 aa29.31■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 GPATCH3Q96I76 525 aa29.31■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 PDE1AP54750 535 aa29.29■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 SALL3Q9BXA9 1300 aa29.29■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 COL4A1P02462 1669 aa29.28■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.28■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 NPR1P16066 1061 aa29.28■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.28■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 STAP2Q9UGK3 403 aa29.28■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF609O15014 1411 aa29.27■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.27■■■□□ 2.28
MEIS3-204ENST00000558555 PDE8BO95263 885 aa29.26■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 SRGNP10124 158 aa29.26■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.26■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 AOX1Q06278 1338 aa29.26■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 CHRNDQ07001 517 aa29.25■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 H0YIN7 160 aa29.25■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 ATP2B3Q16720 1220 aa29.25■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.25■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.25■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 TTC41PQ6P2S7 1318 aa29.25■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 A0A1B0GUL7 405 aa29.24■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 MASTLQ96GX5 879 aa29.24■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.24■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 BBOX1O75936 387 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 TTC22Q5TAA0 569 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 MINPP1Q9UNW1 487 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 ERC2O15083 957 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 ALDH1B1P30837 517 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 TIMM10P62072 90 aa29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.22■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.22■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 TMC4Q7Z404 712 aa29.22■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.22■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 A0A1B0GUL6 1792 aa29.22■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.21■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 DBNDD2Q9BQY9 259 aa29.21■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 TAF5LO75529 589 aa29.2■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 GORABQ5T7V8 394 aa29.2■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 LPIN2Q92539 896 aa29.2■■■□□ 2.27
MEIS3-204ENST00000558555 SLC5A1P13866 664 aa29.2■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 STYK1Q6J9G0 422 aa29.2■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 KIF13BQ9NQT8 1826 aa29.18■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 XAGE2Q96GT9 111 aa29.17■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 FGFR2P21802 821 aa29.17■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 PI4K2BQ8TCG2 481 aa29.17■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.16■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 KCNJ4P48050 445 aa29.16■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 UBE4AQ14139 1066 aa29.16■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.16■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 CHRNA5P30532 468 aa29.15■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 CACNA1SQ13698 1873 aa29.15■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.15■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 CNKSR1Q969H4 720 aa29.15■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.15■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 ADORA1P30542 326 aa29.14■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
MEIS3-204ENST00000558555 ATP5JP18859 108 aa29.14■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 GPR162Q16538 588 aa29.14■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 XDHP47989 1333 aa29.13■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 SP8Q8IXZ3 490 aa29.13■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.13■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 TTC39AQ5SRH9 613 aa29.12■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.12■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.12■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.11■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 WWC3Q9ULE0 1092 aa29.11■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 SNAP23O00161 211 aa29.11■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.11■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 SDSP20132 328 aa29.1■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 AK9Q5TCS8 1911 aa29.1■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 TGFB2P61812 414 aa29.09■■■□□ 2.25
MEIS3-204ENST00000558555 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms