RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 NPHP1O15259 732 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 KRT24Q2M2I5 525 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 SOGA3Q5TF21 947 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 NGEFQ8N5V2 710 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 CAPNS2Q96L46 248 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 BABAM1Q9NWV8 329 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-217ENST00000550044 NBPF26B4DH59 902 aa12.52□□□□□ -0.41
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CS-217ENST00000550044 NBPF15Q8N660 670 aa12.52□□□□□ -0.41
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CS-217ENST00000550044 MCOLN1Q9GZU1 580 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa12.51□□□□□ -0.41
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CS-217ENST00000550044 ECE1P42892 770 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 CCDC93Q567U6 631 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 CNBD1Q8NA66 436 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 NECTIN2Q92692 538 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 MYL6BP14649 208 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 ST5P78524 1137 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 WWC1Q8IX03 1113 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 MASTLQ96GX5 879 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 MBIPQ9NS73 344 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 TRPM7Q96QT4 1865 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 ZNF853P0CG23 659 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 GNAI1P63096 354 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 HOMEZQ8IX15 550 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 BCORQ6W2J9 1755 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 AOC2O75106 756 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 ANXA1P04083 346 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 CCDC27Q2M243 656 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 OLFM4Q6UX06 510 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 Q6ZNB5 142 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 SETDB2Q96T68 719 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 IFT57Q9NWB7 429 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 CCER2I3L3R5 266 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 CAMTA2O94983 1202 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 DGKZQ13574 1117 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 C7orf43Q8WVR3 580 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
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CS-217ENST00000550044 PTPREP23469 700 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 PROSER3Q2NL68 480 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 GPC2Q8N158 579 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 GJA3Q9Y6H8 435 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-217ENST00000550044 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 FZD9O00144 591 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 IARSP41252 1262 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 DSG2Q14126 1118 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 PDIA6Q15084 440 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 HLFQ16534 295 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 CA12O43570 354 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 NPR1P16066 1061 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 MAP2K2P36507 400 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 SOX10P56693 466 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 CST9Q5W186 159 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 TSPYL6Q8N831 410 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 NBPF3Q9H094 633 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 COL4A5P29400 1685 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 FAM177BA6PVY3 158 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 KIF6Q6ZMV9 814 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 COPS6Q7L5N1 327 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 WDR63Q8IWG1 891 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 SYNE4Q8N205 404 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 JDP2Q8WYK2 163 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 ERBB4Q15303 1308 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-217ENST00000550044 EPS15P42566 896 aa12.42□□□□□ -0.42
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