RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-208ENST00000540606 TMTC2Q8N394 836 aa15.21■□□□□ 0.03
ATE1-208ENST00000540606 FLT4P35916 1363 aa15.21■□□□□ 0.03
ATE1-208ENST00000540606 NAPAP54920 295 aa15.21■□□□□ 0.03
ATE1-208ENST00000540606 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.21■□□□□ 0.03
ATE1-208ENST00000540606 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.21■□□□□ 0.03
ATE1-208ENST00000540606 ORAI2Q96SN7 254 aa15.21■□□□□ 0.03
ATE1-208ENST00000540606 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.21■□□□□ 0.03
ATE1-208ENST00000540606 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.21■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TFCP2Q12800 502 aa15.21■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CCDC174Q6PII3 467 aa15.21■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.21■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TTC16Q8NEE8 873 aa15.21■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 RXRAP19793 462 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 STX1AQ16623 288 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TCHPQ9BT92 498 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 RLBP1P12271 317 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 SPECC1Q5M775 1068 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CASQ1P31415 396 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 A2MP01023 1474 aa15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 AKR1B10O60218 316 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TIMM10P62072 90 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 UBE2HP62256 183 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 HOOK3Q86VS8 718 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 NYXQ9GZU5 481 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 EXOC1Q9NV70 894 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ATP10BO94823 1461 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 PLCH2O75038 1416 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ADCY5O95622 1261 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 SPAG5Q96R06 1193 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ERMNQ8TAM6 284 aa15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TNNI2P48788 182 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 GNAQP50148 359 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 POLD1P28340 1107 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 HOXC9P31274 260 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 STAT6P42226 847 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 FERMT2Q96AC1 680 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ERICH4A6NGS2 130 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 SP4Q02446 784 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CALM1P0DP23 149 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CALM2P0DP24 149 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CALM3P0DP25 149 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 KANK3Q6NY19 840 aa15.18■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 DRC1Q96MC2 740 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 PSMD1Q99460 953 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CA8P35219 290 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 NBPF14Q5TI25 921 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CEP85Q6P2H3 762 aa15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ASIC1P78348 528 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 G2E3Q7L622 706 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 GBP3Q9H0R5 595 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 IP6K1Q92551 441 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 APOBRQ0VD83 1088 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 DACT1Q9NYF0 836 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 PTPRKQ15262 1439 aa15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TESK2Q96S53 571 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 JADE2Q9NQC1 790 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 PHACTR2O75167 634 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 DHX58Q96C10 678 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 TRIM75PA6NK02 468 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 C6orf50Q9HD87 102 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 NPATQ14207 1427 aa15.15■□□□□ 0.02
ATE1-208ENST00000540606 A1BGP04217 495 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms