RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
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NELFE-211ENST00000492185 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 XAGE2Q96GT9 111 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
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NELFE-211ENST00000492185 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFE-211ENST00000492185 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.01■■□□□ 1.43
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NELFE-211ENST00000492185 SLC27A2O14975 620 aa24■■□□□ 1.43
NELFE-211ENST00000492185 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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NELFE-211ENST00000492185 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.99■■□□□ 1.43
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NELFE-211ENST00000492185 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.99■■□□□ 1.43
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NELFE-211ENST00000492185 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.98■■□□□ 1.43
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NELFE-211ENST00000492185 AK2P54819 239 aa23.96■■□□□ 1.43
NELFE-211ENST00000492185 GSE1Q14687 1217 aa23.96■■□□□ 1.43
NELFE-211ENST00000492185 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.96■■□□□ 1.43
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NELFE-211ENST00000492185 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.93■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.93■■□□□ 1.42
NELFE-211ENST00000492185 KCNQ4P56696 695 aa23.92■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.92■■□□□ 1.42
NELFE-211ENST00000492185 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.92■■□□□ 1.42
NELFE-211ENST00000492185 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.92■■□□□ 1.42
NELFE-211ENST00000492185 NARFQ9UHQ1 456 aa23.92■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 PTMSP20962 102 aa23.91■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 LAMA4Q16363 1823 aa23.9■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 FAM177BA6PVY3 158 aa23.89■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 ZAP70P43403 619 aa23.89■■□□□ 1.42
NELFE-211ENST00000492185 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
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NELFE-211ENST00000492185 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
NELFE-211ENST00000492185 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
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