RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 NRLP54845 237 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 PLAURQ03405 335 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 PERM1Q5SV97 790 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 NACC1Q96RE7 527 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 DYRK3O43781 588 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 MMP20O60882 483 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 RAC1P63000 192 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP13Q86W25 1043 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 GPR152Q8TDT2 470 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0A0MRY4 1105 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 GHRHP01286 108 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 GRIK4Q16099 956 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 RBSNQ9H1K0 784 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 SCNN1AP37088 669 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 HELQQ8TDG4 1101 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-211ENST00000484135 J3QW42 95 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB39O15060 712 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 SOX18P35713 384 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 MSL1Q68DK7 614 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ARID3AQ99856 593 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 NESP48681 1621 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ELNP15502 786 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 SSFA2P28290 1259 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 SIK1P57059 783 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ATCAYQ86WG3 371 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 PLD4Q96BZ4 506 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 CARNS1A5YM72 827 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 GRIK5Q16478 980 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR7Q9Y216 660 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf172C9J069 976 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 PCSK2P16519 638 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 MPSTP25325 297 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 EDEM1Q92611 657 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 TTC9Q92623 222 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 TTC16Q8NEE8 873 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 OR13H1Q8NG92 308 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 SPACA7Q96KW9 195 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 USP21Q9UK80 565 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 HYAL2Q12891 473 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR3Q13615 1198 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 LRP8Q14114 963 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-211ENST00000484135 ABL1P00519 1130 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 SELPP16109 830 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 AAMPQ13685 434 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf34Q49A92 452 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 USTQ9Y2C2 406 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 CFTRP13569 1480 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRE1Q14246 886 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ELP3Q9H9T3 547 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 PDGFAP04085 211 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 ATP11AP98196 1134 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 MBTPS1Q14703 1052 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO11Q86XK2 927 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-211ENST00000484135 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
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