RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473298.6

SOGA3-205, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SOGA3, Length 3,350 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-205ENST00000473298 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.9□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 EXOC5O00471 708 aa11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ALS2Q96Q42 1657 aa11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 KCNQ2O43526 872 aa11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.89□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 DDIT3P35638 169 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 NFXL1Q6ZNB6 911 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 NEK1Q96PY6 1258 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ATP6V1AP38606 617 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 TSPY26PQ9H489 355 aa11.88□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CPLX1O14810 134 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CYP21A2P08686 494 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 TSC1Q92574 1164 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 BIN1O00499 593 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 BRD1O95696 1058 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SLIT3O75094 1523 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 STARD3NLO95772 234 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 F13A1P00488 732 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ITGA6P23229 1130 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 MICU3Q86XE3 530 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ZBTB9Q96C00 473 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 XAGE2Q96GT9 111 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.87□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 FSD2A1L4K1 749 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PTPN21Q16825 1174 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SPATA32Q96LK8 384 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 MCM2P49736 904 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 CPDO75976 1380 aa11.86□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 HOXB7P09629 217 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 LIG1P18858 919 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PSMA5P28066 241 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ME1P48163 572 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 ATP2B3Q16720 1220 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 VPS37DQ86XT2 251 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 AFF2P51816 1311 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 DACT1Q9NYF0 836 aa11.85□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 M0R2C6 588 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 EYA2O00167 538 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PRDM1O75626 825 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 DDB1Q16531 1140 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SLC51AQ86UW1 340 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 AIFM3Q96NN9 605 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 OSBP2Q969R2 916 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 PHKA1P46020 1223 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.51
SOGA3-205ENST00000473298 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 LUZP1Q86V48 1076 aa11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 MTMR6Q9Y217 621 aa11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 NECTIN1Q15223 517 aa11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 ATG3Q9NT62 314 aa11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 SMIM22K7EJ46 135 aa11.82□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 RPS6KB1P23443 525 aa11.82□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 FOXO4P98177 505 aa11.82□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 SPECC1Q5M775 1068 aa11.82□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 TTC6Q86TZ1 520 aa11.82□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 PHKBQ93100 1093 aa11.82□□□□□ -0.52
SOGA3-205ENST00000473298 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms