RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 PALLDQ8WX93 1383 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 EYA2O00167 538 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 C4BP0C0L5 1744 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 PTH1RQ03431 593 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 DDB1Q16531 1140 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 MAP4K1Q92918 833 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 GPATCH3Q96I76 525 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 HAUS7Q99871 368 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 SIL1Q9H173 461 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A0D9SFI3 127 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 CAMTA2O94983 1202 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 SIK1P57059 783 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 AK7Q96M32 723 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-210ENST00000462363 FAM227BQ96M60 508 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRC-210ENST00000462363 TAF5LO75529 589 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 MCCP23508 829 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 SSFA2P28290 1259 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRC-210ENST00000462363 NEK4P51957 841 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CTSWP56202 376 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ST3GAL1Q11201 340 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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