RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LONRF1Q17RB8 773 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 Q3C1V9 767 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IL31Q6EBC2 164 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATCAYQ86WG3 371 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GJD3Q8N144 294 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 UBR7Q8N806 425 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF454Q8N9F8 522 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ERP27Q96DN0 273 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MFSD3Q96ES6 412 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KCNH8Q96L42 1107 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NBPF3Q9H094 633 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CAAP1Q9H8G2 361 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAP10Q9P2G4 905 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POLG2Q9UHN1 485 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POLIQ9UNA4 740 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GPSM3Q9Y4H4 160 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BICDL2A1A5D9 508 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TTC36A6NLP5 189 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIM37O94972 964 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SOX5P35711 763 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NEK3P51956 506 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RASGRF1Q13972 1273 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DDR2Q16832 855 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ALDH1L2Q3SY69 923 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TM4SF20Q53R12 229 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DGKHQ86XP1 1220 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ATL2Q8NHH9 583 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBXO41Q8TF61 875 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAJC25Q9H1X3 360 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 USP25Q9UHP3 1055 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AKAP2Q9Y2D5 859 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRRT4C9JH25 899 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMAPO00193 183 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 F12P00748 615 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RBP3P10745 1247 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 COL9A1P20849 921 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM160A1Q05DH4 1040 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 APOBRQ0VD83 1088 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PICALMQ13492 652 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TOMM20Q15388 145 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MTERF2Q49AM1 385 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TNNI3KQ59H18 835 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDXDC2PQ6P474 469 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MORC1Q86VD1 984 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NIM1KQ8IY84 436 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PIP4P2Q8N4L2 257 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ADAM32Q8TC27 787 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 OSBPL7Q9BZF2 842 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CDH19Q9H159 772 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CLIC5Q9NZA1 410 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PFDN2Q9UHV9 154 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KDM2BQ8NHM5 1336 aa3.96□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 A0A087X0B3 334 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RASSF10A6NK89 507 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRSS47A8MTI9 375 aa3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.2 ms