RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 COL4A1P02462 1669 aa25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 RILPL2Q969X0 211 aa25.06■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.06■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.06■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 CDC45O75419 566 aa25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 TIMM10P62072 90 aa25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1B0GUL7 405 aa25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 MMP10P09238 476 aa25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 ATP2B3Q16720 1220 aa25.03■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1B0GUL6 1792 aa25.02■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.02■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 PDE8BO95263 885 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 GORABQ5T7V8 394 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 SEC24BO95487 1268 aa25■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 CASC1Q6TDU7 716 aa25■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 CNTROBQ8N137 903 aa25■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 BOLA2Q9H3K6 86 aa25■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 TAF5LO75529 589 aa24.99■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 XAGE2Q96GT9 111 aa24.99■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.99■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 CHRNDQ07001 517 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 ATP5JP18859 108 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 ADORA1P30542 326 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 GRAPQ13588 217 aa24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-204ENST00000402096 SLC5A1P13866 664 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 CRY2Q49AN0 593 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 LPIN2Q92539 896 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.95■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 EVI5LQ96CN4 794 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 FGFR2P21802 821 aa24.93■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 PDE6BP35913 854 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 SNAP23O00161 211 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 HAUS7Q99871 368 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.91■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 CACNA1SQ13698 1873 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 CHMLP26374 656 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 FSD1Q9BTV5 496 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 KCNJ4P48050 445 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-204ENST00000402096 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 UBE4AQ14139 1066 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC102BQ68D86 513 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 GOLIM4O00461 696 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 SRGNP10124 158 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 NPR1P16066 1061 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 PHKA1P46020 1223 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 SNRKQ9NRH2 765 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 BBOX1O75936 387 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 SCARF1Q14162 830 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 HIP1O00291 1037 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.572e-6■■□□□ 11.6
ATG4B-204ENST00000402096 MASTLQ96GX5 879 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-204ENST00000402096 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.83■■□□□ 1.57
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