RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 ERC2O15083 957 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 NPR1P16066 1061 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 CRY2Q49AN0 593 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 GORABQ5T7V8 394 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF609O15014 1411 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ALDH1B1P30837 517 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 AOX1Q06278 1338 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 PDE8BO95263 885 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ4P48050 445 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 PDE1AP54750 535 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 CHRNDQ07001 517 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ATP2B3Q16720 1220 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 TMC4Q7Z404 712 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 MASTLQ96GX5 879 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 AK9Q5TCS8 1911 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GUL7 405 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 BBOX1O75936 387 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 SRGNP10124 158 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 SLC5A1P13866 664 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 TTC22Q5TAA0 569 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-201ENST00000368202 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TIMM10P62072 90 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 STYK1Q6J9G0 422 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 LPIN2Q92539 896 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 STAP2Q9UGK3 403 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 COL4A1P02462 1669 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TAF5LO75529 589 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 CNKSR1Q969H4 720 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 UBE4AQ14139 1066 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 KLHL34Q8N239 644 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 CASC1Q6TDU7 716 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 CNTROBQ8N137 903 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 RILPL2Q969X0 211 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 XAGE2Q96GT9 111 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 SPON1Q9HCB6 807 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 CHRNA5P30532 468 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 SP8Q8IXZ3 490 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 XDHP47989 1333 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 ATP5JP18859 108 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 ATP2B4P23634 1241 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 TGFB2P61812 414 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 VPS37DQ86XT2 251 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-201ENST00000368202 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-201ENST00000368202 FGFR2P21802 821 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-201ENST00000368202 ADORA1P30542 326 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-201ENST00000368202 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-201ENST00000368202 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-201ENST00000368202 GGA1Q9UJY5 639 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-201ENST00000368202 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-201ENST00000368202 UFL1O94874 794 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms