RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361716.7

VAMP1-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP1, Length 3,449 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-201ENST00000361716 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CASQ1P31415 396 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CCZ1BP86790 482 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 IL17REQ8NFR9 667 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 PGBD1Q96JS3 809 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 BRF1Q92994 677 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP1-201ENST00000361716 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.77□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.77□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 BTBD11A6QL63 1104 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CHGBP05060 677 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 FSIP1Q8NA03 581 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CCDC102AQ96A19 550 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 GNG11P61952 73 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SLC20A2Q08357 652 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 DEF6Q9H4E7 631 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ANO10Q9NW15 660 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SERPINC1P01008 464 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 PSMA5P28066 241 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 VPS53Q5VIR6 699 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 GSDMDP57764 484 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CFAP100Q494V2 611 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 DLC1Q96QB1 1528 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 A0A1B0GVL5 298 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SASH3O75995 380 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ST3GAL1Q11201 340 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 IQCB1Q15051 598 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ICE2Q659A1 982 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 EFCC1Q9HA90 598 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ERBB3P21860 1342 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 C3P01024 1663 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 PTPRUQ92729 1446 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ADGRB2O60241 1585 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 A0A0D9SFI3 127 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SLC39A6Q13433 755 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SSH3Q8TE77 659 aa14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 CFAP45Q9UL16 551 aa14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
VAMP1-201ENST00000361716 A0A1B0GUL7 405 aa14.7□□□□□ -0.06
VAMP1-201ENST00000361716 PROSER3Q2NL68 480 aa14.7□□□□□ -0.06
VAMP1-201ENST00000361716 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.7□□□□□ -0.06
VAMP1-201ENST00000361716 A0A0G2JS52 829 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167.7 ms