RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RIMBP2O15034 1052 aa25.58■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 CHST3Q7LGC8 479 aa25.58■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.58■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 SIRT1Q96EB6 747 aa25.58■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 GRIN2AQ12879 1464 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 PHACTR2O75167 634 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.57■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 OGFOD1Q8N543 542 aa25.56■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 IL16Q14005 1332 aa25.56■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 AKR1B10O60218 316 aa25.55■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 DPH6Q7L8W6 267 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.55■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 PDE1AP54750 535 aa25.54■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 FSD2A1L4K1 749 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 CEP135Q66GS9 1140 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 GJC1P36383 396 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 KSR2Q6VAB6 950 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 FAM212AQ96EL1 285 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.53■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 SPAG5Q96R06 1193 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ACTN2P35609 894 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 DHX58Q96C10 678 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.52■■□□□ 1.68
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PTPRM-201ENST00000332175 USP48Q86UV5 1035 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 TMTC2Q8N394 836 aa25.51■■□□□ 1.67
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PTPRM-201ENST00000332175 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 POTEB2H3BUK9 544 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.51■■□□□ 1.67
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PTPRM-201ENST00000332175 CEP63Q96MT8 703 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 FAM107BQ9H098 131 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 ATP8B2P98198 1209 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 TICAM2Q86XR7 235 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 IKBKGQ9Y6K9 419 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.49■■□□□ 1.67
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PTPRM-201ENST00000332175 NYXQ9GZU5 481 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
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PTPRM-201ENST00000332175 RXRAP19793 462 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 TFCP2Q12800 502 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 TCHPQ9BT92 498 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 TNNI2P48788 182 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-201ENST00000332175 IL2RBP14784 551 aa25.47■■□□□ 1.67
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