RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306121.7

SNX7-201, Transcript of sorting nexin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX7, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7-201ENST00000306121 ABCC12Q96J65 1359 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX7-201ENST00000306121 KCNB2Q92953 911 aa25.51■■□□□ 1.68
SNX7-201ENST00000306121 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
SNX7-201ENST00000306121 NARFQ9UHQ1 456 aa25.51■■□□□ 1.68
SNX7-201ENST00000306121 GOLIM4O00461 696 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 GNPATO15228 680 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 GORABQ5T7V8 394 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 MAP4K1Q92918 833 aa25.51■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 C4BP0C0L5 1744 aa25.5■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 RASEFQ8IZ41 740 aa25.5■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.5■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 PDE8BO95263 885 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 NECTIN1Q15223 517 aa25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 CASZ1Q86V15 1759 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 SMIM5Q71RC9 77 aa25.47■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 C4AP0C0L4 1744 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 TAF5LO75529 589 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SNX7-201ENST00000306121 ZPR1O75312 459 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 KCNJ4P48050 445 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 ERFEQ4G0M1 354 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.45■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 TMX3Q96JJ7 454 aa25.44■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 CHGBP05060 677 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 FGFR2P21802 821 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 LPIN2Q92539 896 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 TTC14Q96N46 770 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 SLC27A2O14975 620 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 SCARF1Q14162 830 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 NYXQ9GZU5 481 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 SSFA2P28290 1259 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 RNF20Q5VTR2 975 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 SETDB2Q96T68 719 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 MYH7P12883 1935 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 CUL4AQ13619 759 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX7-201ENST00000306121 ZAP70P43403 619 aa25.39■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.39■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.39■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 COL4A1P02462 1669 aa25.39■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 SLC5A1P13866 664 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 MCAMP43121 646 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.38■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 CCDC102BQ68D86 513 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 A0A1B0GUL6 1792 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX7-201ENST00000306121 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.37■■□□□ 1.65
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