RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296051.6

HPS3-201, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS3, Length 4,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-201ENST00000296051 RIMBP2O15034 1052 aa15.51■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 ATP10AO60312 1499 aa15.51■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.48■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 CNNM3Q8NE01 707 aa15.48■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 PYCARDQ9ULZ3 195 aa15.48■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 JAG2Q9Y219 1238 aa15.48■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 LIG1P18858 919 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS3-201ENST00000296051 CEP170Q5SW79 1584 aa15.47■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.47■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.47■□□□□ 0.07
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HPS3-201ENST00000296051 PHACTR2O75167 634 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS3-201ENST00000296051 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS3-201ENST00000296051 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS3-201ENST00000296051 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS3-201ENST00000296051 ADGRL2O95490 1459 aa15.46■□□□□ 0.06
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HPS3-201ENST00000296051 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.45■□□□□ 0.06
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HPS3-201ENST00000296051 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.45■□□□□ 0.06
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HPS3-201ENST00000296051 DNA2P51530 1060 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 CNBD1Q8NA66 436 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 APOBRQ0VD83 1088 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 SGSM2O43147 1006 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 IL13P35225 146 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 KSR2Q6VAB6 950 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS3-201ENST00000296051 RUFY3Q7L099 469 aa15.44■□□□□ 0.06
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