RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266679.8

CPSF6-201, Transcript of cleavage and polyadenylation specific factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPSF6, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6-201ENST00000266679 ST3GAL1Q11201 340 aa15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 NECAB1Q8N987 351 aa15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.43■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 F13A1P00488 732 aa15.42■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 A1BGP04217 495 aa15.42■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 ME3Q16798 604 aa15.42■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.42■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.42■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 KCNQ2O43526 872 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 RNF20Q5VTR2 975 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 BTAF1O14981 1849 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 IL2RBP14784 551 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 PSMA5P28066 241 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 FOXO4P98177 505 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 ZNF609O15014 1411 aa15.41■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.4■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 H7C1W4 665 aa15.4■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 CHGBP05060 677 aa15.4■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.4■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.4■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.4■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CPSF6-201ENST00000266679 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 FIBPO43427 364 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 TAF5LO75529 589 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 RPS6KB1P23443 525 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 MTMR6Q9Y217 621 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 RNF214Q8ND24 703 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 HAUS7Q99871 368 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 TSPY26PQ9H489 355 aa15.39■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.38■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 UTRNP46939 3433 aa15.38■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 BCL9O00512 1426 aa15.38■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.37■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.37■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.37■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.37■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 PROM2Q8N271 834 aa15.37■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 LAMA4Q16363 1823 aa15.37■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 PHF14O94880 888 aa15.36■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 ANKRD1Q15327 319 aa15.36■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 STK3Q13188 491 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 LRRC24Q50LG9 513 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 GOLIM4O00461 696 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 PLSCR1O15162 318 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 TIMM10P62072 90 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 UBE2HP62256 183 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 CASZ1Q86V15 1759 aa15.35■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 PALLDQ8WX93 1383 aa15.34■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 KRT32Q14532 448 aa15.33■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.33■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.33■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.33■□□□□ 0.05
CPSF6-201ENST00000266679 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.33■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 EYA2O00167 538 aa15.33■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 TXNRD1Q16881 649 aa15.33■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 NEK1Q96PY6 1258 aa15.33■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 ITGB4P16144 1822 aa15.33■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.32■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 FERMT3Q86UX7 667 aa15.32■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 GPR108Q9NPR9 543 aa15.32■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 CYP21A2P08686 494 aa15.32■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 Q6ZUG5 572 aa15.31■□□□□ 0.04
CPSF6-201ENST00000266679 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms