RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 TICAM2Q86XR7 235 aa20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 XAGE2Q96GT9 111 aa20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 C4AP0C0L4 1744 aa20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 NFIXQ14938 502 aa20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.37■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.36■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 ABCC12Q96J65 1359 aa20.36■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.36■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 NLRP3Q96P20 1036 aa20.36■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.35■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 GYS1P13807 737 aa20.35■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 FSD1Q9BTV5 496 aa20.35■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 GORABQ5T7V8 394 aa20.34■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.34■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 IL25Q9H293 177 aa20.34■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.34■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 AK9Q5TCS8 1911 aa20.34■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 FGFR2P21802 821 aa20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 ADORA1P30542 326 aa20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 LPIN2Q92539 896 aa20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 SNX21Q969T3 373 aa20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 AKT1S1Q96B36 256 aa20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 SNRKQ9NRH2 765 aa20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 RAD50Q92878 1312 aa20.33■□□□□ 0.85
TVP23C-201ENST00000225576 MCCP23508 829 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 TM4SF1P30408 202 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 RABEP1Q15276 862 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.32■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.31■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 SLC4A3P48751 1232 aa20.31■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.31■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 IL17RAQ96F46 866 aa20.31■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.31■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 ANAPC15P60006 121 aa20.3■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF827Q17R98 1081 aa20.3■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 CNBD1Q8NA66 436 aa20.3■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 NPHP1O15259 732 aa20.29■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 SLC5A1P13866 664 aa20.29■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.29■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 FAM227BQ96M60 508 aa20.29■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.29■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 GOLIM4O00461 696 aa20.28■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 CHRNDQ07001 517 aa20.28■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 SERPINB2P05120 415 aa20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 HSPA4P34932 840 aa20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 HSCBQ8IWL3 235 aa20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 SPEF2Q9C093 1822 aa20.27■□□□□ 0.84
TVP23C-201ENST00000225576 A0A0D9SFI3 127 aa20.27■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 TAF5LO75529 589 aa20.27■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC102BQ68D86 513 aa20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 IL27Q8NEV9 243 aa20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 MED23Q9ULK4 1368 aa20.26■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 ST5P78524 1137 aa20.25■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 SCARF1Q14162 830 aa20.25■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.24■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 MCAMP43121 646 aa20.24■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 UBE4AQ14139 1066 aa20.24■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 COL4A1P02462 1669 aa20.24■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 ZAP70P43403 619 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 PHKA1P46020 1223 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 PTH1RQ03431 593 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 DDR1Q08345 913 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.23■□□□□ 0.83
TVP23C-201ENST00000225576 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms