RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnf1Q7TSH7 493 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rps6ka5Q8C050 863 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AK157302I3ITR1 129 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21985Q6P6P5 1106 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plcd3Q8K2J0 785 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Isca1Q9D924 129 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prl3d2F6R3P9 224 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cavin1O54724 392 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kif3aP28741 701 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lmbrd2Q8C561 694 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abca3Q8R420 1704 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ptgs1P22437 602 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smc4Q8CG47 1286 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cfap58B2RW38 873 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hmx1O70218 332 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FosbP13346 338 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myd88P22366 296 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nucb2P81117 420 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ints5Q8CHT3 1018 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Inpp5bQ8K337 993 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt25Q8VCW2 446 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hmgn5Q9JL35 406 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa26.58■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gsdma2Q32M21 443 aa26.58■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa26.58■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bcl9lQ67FY2 1494 aa26.58■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eya2O08575 532 aa26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp28Q5I043 1051 aa26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 BrapQ99MP8 591 aa26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ehd4Q9EQP2 541 aa26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rdm1Q9CQK3 281 aa26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cct2P80314 535 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ifit1Q64282 463 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtmr3Q8K296 1196 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrc1Q61830 1456 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem266Q8BZB3 538 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Asap2Q7SIG6 958 aa26.55■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pms1Q8K119 917 aa26.55■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa26.55■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rufy2Q8R4C2 606 aa26.54■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam213aQ9CYH2 218 aa26.54■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AidaQ8C4Q6 305 aa26.54■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grpel1Q99LP6 217 aa26.54■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atad2Q8CDM1 1040 aa26.53■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fsd1Q7TPM6 496 aa26.53■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Txnrd1Q9JMH6 613 aa26.53■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trim59Q922Y2 403 aa26.52■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ciao1Q99KN2 339 aa26.52■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam84aQ9D650 292 aa26.52■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppfia3P60469 1194 aa26.51■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc19Q8CC21 365 aa26.51■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Osbpl5Q9ER64 874 aa26.51■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Aox4Q3TYQ9 1336 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm973E9Q295 1059 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc4a1P04919 929 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem109Q3UBX0 243 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mctp2Q5RJH2 878 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Taok2Q6ZQ29 1240 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AbraQ8BUZ1 375 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc112A0AUP1 442 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rgs9O54828 675 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TrhQ62361 256 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ncaph2Q8BSP2 607 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem67Q8BR76 992 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Irf5P56477 497 aa26.49■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2d34L7N463 504 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ercc3P49135 783 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hook1Q8BIL5 728 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubxn4Q8VCH8 506 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TnksQ6PFX9 1320 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spty2d1Q68FG3 682 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nrbp1Q99J45 535 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubn2Q80WC1 1314 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clec11aO88200 328 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MsnP26041 577 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdca8Q8BHX3 289 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Serpina10Q8R121 448 aa26.46■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rapgef3Q8VCC8 918 aa26.46■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tpd52l1O54818 204 aa26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.9 ms