RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038356.12

Ube2q1-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2q1, Length 3,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ubxn4Q8VCH8 506 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rassf8Q8CJ96 419 aa25.51■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Neurod6P48986 337 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kcnk13Q8R1P5 405 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ano10Q8BH79 659 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm7361D3Z6R1 267 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm1979E9QAN3 267 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm5862K7N5V5 267 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gm10220K7N660 267 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 ZgpatQ8VDM1 511 aa25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 DccP70211 1447 aa25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Irgm2A0A140LIF8 407 aa25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Asic4Q7TNS7 539 aa25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Sh3bp5Q9Z131 463 aa25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Grm8P47743 908 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zkscan4Q5SZT6 480 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Stx1aO35526 288 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Plekhd1B2RPU2 505 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Clec11aO88200 328 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Irx2P81066 474 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Abcc12Q80WJ6 1366 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dlg5E9Q9R9 1921 aa25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mst1rQ62190 1378 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Atp2b1G5E829 1220 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Irf9Q61179 399 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 PsapQ61207 557 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 GckrQ91X44 587 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Col1a2Q01149 1372 aa25.46■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ms4a1P19437 291 aa25.45■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kcnj4P52189 445 aa25.45■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cct2P80314 535 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Hmg20bQ9Z104 317 aa25.45■■□□□ 1.67
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa25.45■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Atp10bB1AWN4 1474 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mtmr3Q8K296 1196 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dusp10Q9ESS0 483 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Zeb2Q9R0G7 1215 aa25.44■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Tpm1P58771 284 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Limch1Q3UH68 1057 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Slc5a1Q8C3K6 665 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Elf2Q9JHC9 593 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccdc112A0AUP1 442 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Cnnm1Q0GA42 951 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccer1Q9CQL2 403 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 PigbQ9JJQ0 542 aa25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Gpatch3Q8BIY1 525 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rhot2Q8JZN7 620 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Lrrfip2Q91WK0 415 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Tubb6Q922F4 447 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dnaaf4Q8R368 420 aa25.42■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Odf2lQ9D478 642 aa25.41■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Znf568E9PYI1 671 aa25.41■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Qtrt2B8ZXI1 415 aa25.4■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Surf1P09925 306 aa25.4■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 SympkQ80X82 1284 aa25.4■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Q8BZJ8 459 aa25.4■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Vps54Q5SPW0 977 aa25.39■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Slit1Q80TR4 1531 aa25.39■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 RubcnlQ3TD16 648 aa25.39■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Tmem109Q3UBX0 243 aa25.39■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa25.39■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Samsn1P57725 372 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Prkab2Q6PAM0 271 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Ggt6Q6PDE7 497 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Frat2Q8K025 231 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Prl7a2O54831 253 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Hspa2P17156 633 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Slc39a6Q8C145 765 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Serpinb6bO08804 377 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 DbnlQ62418 436 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Dhx38Q80X98 1228 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Nek11Q8C0Q4 628 aa25.38■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Flt4P35917 1363 aa25.37■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 XpcP51612 930 aa25.37■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Vps33aQ9D2N9 598 aa25.37■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Pus3Q9JI38 481 aa25.37■■□□□ 1.65
Ube2q1-201ENSMUST00000038356 Abca15E9PWH4 1668 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 82.9 ms