RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mlh1Q9JK91 760 aa14.14□□□□□ -0.15
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g4fQ50L41 855 aa14.11□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnq5Q9JK45 933 aa14.11□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kndc1Q0KK55 1742 aa14.11□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 CrcpO35427 148 aa14.11□□□□□ -0.15
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Osbpl5Q9ER64 874 aa14.1□□□□□ -0.15
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp4r3bQ922R5 820 aa14.1□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nphp3Q7TNH6 1325 aa14.1□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zkscan16A2ALW2 728 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 HlfQ8BW74 295 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 AidaQ8C4Q6 305 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k15A2AQW0 1331 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Setdb1O88974 1307 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekhf1Q3TB82 279 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nek11Q8C0Q4 628 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rad50P70388 1312 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf692Q3U381 531 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Letm1Q9Z2I0 738 aa14.09□□□□□ -0.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh1Q5SX40 1942 aa14.09□□□□□ -0.15
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ak2Q9WTP6 239 aa14.08□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa14.08□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 NfixP70257 488 aa14.08□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube3bQ9ES34 1070 aa14.08□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3dQ91WD1 398 aa14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapkapk5O54992 473 aa14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp6v0a2P15920 856 aa14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 NsmfQ99NF2 532 aa14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap69Q8BH53 942 aa14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Filip1lQ6P6L0 1131 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Anapc15P60007 132 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col23a1Q8K4G2 532 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Emilin1Q99K41 1017 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gjb2Q00977 226 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrfip2Q91WK0 415 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9D9S1 216 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mroh6V9GX81 722 aa14.06□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ercc3P49135 783 aa14.05□□□□□ -0.16
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem67Q8BR76 992 aa14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2ab1S4R196 498 aa14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A1W2P7S8 802 aa14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf326O88291 580 aa14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Appbp2Q9DAX9 585 aa14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdf11Q9Z1W4 405 aa14.05□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 EvcP57680 1005 aa14.04□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sept9Q80UG5 583 aa14.04□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hap1O35668 628 aa14.04□□□□□ -0.16
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