RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	OR51B6	Q9H340	312 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0A6YYJ9	748 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	FBP2	O00757	339 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	MSMB	P08118	114 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CCL2	P13500	99 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	COL8A2	P25067	703 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	STOM	P27105	288 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	IL2RG	P31785	369 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	KDELR2	P33947	212 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	LIPA	P38571	399 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	KLF10	Q13118	480 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	HFE	Q30201	348 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	THEM4	Q5T1C6	240 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	C10orf128	Q5T292	105 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	RRM2B	Q7LG56	351 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	RAB1C	Q92928	201 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	STAB1	Q9NY15	2570 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743		A6NIZ1	184 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	GSTA4	O15217	222 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	SLC22A2	O15244	555 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	KRT34	O76011	436 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	IFI30	P13284	250 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	OR1E2	P47887	323 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	RAP1B	P61224	184 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	RAP1A	P62834	184 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	SELENOW	P63302	87 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CCL8	P80075	99 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	SLC3A1	Q07837	685 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	MSMP	Q1L6U9	139 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	PRRC1	Q96M27	445 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TREM2	Q9NZC2	230 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	C5orf49	A4QMS7	147 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CLDN25	C9JDP6	229 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CDC14B	O60729	498 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CLPTM1	O96005	669 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV3-13	P01766	116 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	IFNW1	P05000	195 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	GAA	P10253	952 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	CRYBB2	P43320	205 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF81	P51508	661 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GGA3-208	ENST00000579743	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53

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