RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ADA2Q9NZK5 511 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 GMNCA6NCL1 334 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 VSTM5A8MXK1 200 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 M0R233 179 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SYNGR3O43761 229 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 MGRN1O60291 552 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ENTPD5O75356 428 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NCR1O76036 304 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 DIRAS1O95057 198 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 STAMBPO95630 424 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SNAP29O95721 258 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CLPTM1O96005 669 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SEMG1P04279 462 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LYNX1P0DP58 116 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF32P17041 273 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LIMS1P48059 325 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC9A3P48764 834 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 EVX1P49640 407 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ERVK-25P63136 954 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SEC23BQ15437 767 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TAF11Q15544 211 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 MESTQ5EB52 335 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FGD3Q5JSP0 725 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 GLYATQ6IB77 296 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 C7orf34Q96L11 122 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SOX7Q9BT81 388 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf198Q9H425 327 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SIAEQ9HAT2 523 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CDH20Q9HBT6 801 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PPL8 197 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PPW3 197 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PRQ8 180 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LRP5LA4QPB2 252 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 IMPA2O14732 288 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ARPC2O15144 300 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 HPXP02790 462 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SCG5P05408 212 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 CD14P08571 375 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NAT2P11245 290 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 NR2C1P13056 603 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF23P17027 643 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 RHCEP18577 417 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 IGFBP5P24593 272 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 GIFP27352 417 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 LAP3P28838 519 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 IL2RGP31785 369 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 WNT5AP41221 380 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 OMPP47874 163 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FXYD6P3P58550 94 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 PSG4Q00888 419 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 HSF2Q03933 536 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 GLO1Q04760 184 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 RIN1Q13671 783 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 DGCR6Q14129 220 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TRIP10Q15642 601 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 SGCAQ16586 387 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ZBED5Q49AG3 693 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 THEM4Q5T1C6 240 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms