RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	FOLR3	P41439	243 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	P2RX1	P51575	399 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL11	P51671	97 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	UCN	P55089	124 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R43	P59537	309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFA1	P59665	94 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFA3	P59666	94 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PRPS1	P60891	318 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ACTC1	P68032	377 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ACTA1	P68133	377 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DGCR2	P98153	550 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SCN1B	Q07699	218 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	IL18	Q14116	193 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MELK	Q14680	651 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ACKR1	Q16570	336 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MEP1B	Q16820	701 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730		Q5BKY6	102 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MTFR2	Q6P444	385 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ARSK	Q6UWY0	536 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	UTS2B	Q765I0	119 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TPRA1	Q86W33	373 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB43	Q86YS6	212 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM8	Q8N371	416 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8N402	240 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC7A6	Q92536	515 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	AP3S1	Q92572	193 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	UPRT	Q96BW1	309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM19	Q96E16	107 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ARL5B	Q96KC2	179 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	DERL3	Q96Q80	235 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	WAC	Q9BTA9	647 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SYT4	Q9H2B2	425 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	MED11	Q9P086	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	B9D1	Q9UPM9	204 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5.2	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NCKAP5	O14513	1909 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ARGFX	A6NJG6	315 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6C76	A6NM76	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	NOTO	A8MTQ0	251 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF879	B4DU55	563 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF9	O43307	516 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	LYRM1	O43325	122 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC19A2	O60779	497 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHM	P01871	453 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	APOA1	P02647	267 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	UMOD	P07911	640 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PTHLH	P12272	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	HPGD	P15428	266 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	CTLA4	P16410	223 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKCA	P17252	672 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	PGC	P20142	388 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB3B	P20337	219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	ANOS1	P23352	680 aa		5.19	□□□□□ -1.58
C4BPB-208	ENST00000492730	AHCY	P23526	432 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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