RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		V9GYH0	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	VCAN	P13611	3396 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		A6NIZ1	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C21orf140	B9A014	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247		E9PI62	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PHYH	O14832	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	EFNA2	O43921	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP3	O75074	770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	UPK3A	O75631	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A12	O75746	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2J2	O76002	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	STK17B	O94768	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CDRT1	O95170	752 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HP	P00738	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	REN	P00797	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINA3	P01011	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GYPB	P06028	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	UCHL1	P09936	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ICAM2	P13598	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF17	P17021	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TGM1	P22735	817 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF8	P32971	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SDC2	P34741	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GNAL	P38405	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	FOLR3	P41439	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	P2RY4	P51582	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR12D2	P58182	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RAP1B	P61224	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RAP1A	P62834	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SIRPA	P78324	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC20	Q12834	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXF1	Q12946	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MALL	Q13021	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ACKR1	Q16570	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	RASD2	Q96D21	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	SP140L	Q9H930	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG4A-208	ENST00000489247	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms