RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 GADD45AP24522 165 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 LHFPL3Q86UP9 236 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 POLE4Q9NR33 117 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF716A6NP11 495 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 LINC01387J3KSC0 135 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 SELENOFO60613 162 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ATP6V1E1P36543 226 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 DEFA1P59665 94 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 DEFA3P59666 94 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 IRF3Q14653 427 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 MEP1BQ16820 701 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 LINC01590Q5TEZ4 76 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 KCNK17Q96T54 332 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 FANCFQ9NPI8 374 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 RASD1Q9Y272 281 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CACNA1CQ13936 2221 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 RGS13O14921 159 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TBX1O43435 398 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PSKH1P11801 424 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ETV1P50549 477 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 LY6DQ14210 128 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 EMC4Q5J8M3 183 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ALG12Q9BV10 488 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 RENP00797 406 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PTHP01270 115 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV3-9P01782 118 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TGFBR1P36897 503 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 RFKQ969G6 155 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC32Q9BV29 185 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PRORYQ9H606 182 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 WDR76Q9H967 626 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 B9D1Q9UPM9 204 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 C3P1Q6ZMU1 363 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM80Q96HE8 168 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 OR5M11Q96RB7 305 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TIGARQ9NQ88 270 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TFP02787 698 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PGA4P0DJD7 388 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PGA3P0DJD8 388 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CPN1P15169 458 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 RGS6P49758 472 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 GID4Q8IVV7 300 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CDCA4Q9BXL8 241 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CALHM2Q9HA72 323 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 USP24Q9UPU5 2620 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 A0A075B6Q4 140 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF726A6NNF4 738 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CYTIPO60759 359 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 SCG5P05408 212 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CDAP32320 146 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 SOX6P35712 828 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CLRN1P58418 232 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 SSX6Q7RTT6 188 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 OR2M2Q96R28 347 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GVC2 190 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 PSMD9O00233 223 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 APOA1P02647 267 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF585AQ6P3V2 769 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC190Q86UF4 302 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TEX19Q8NA77 164 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-217ENST00000475693 TRIB1Q96RU8 372 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms