RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PYDC2Q56P42 97 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 IDNKQ5T6J7 187 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF787Q6DD87 383 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SFXN4Q6P4A7 337 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CNIH2Q6PI25 160 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GDPD3Q7L5L3 318 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PM20D2Q8IYS1 436 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FADS6Q8N9I5 356 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF511Q8NB15 262 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OTOSQ8NHW6 89 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF417Q8TAU3 575 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C8orf44Q96CB5 159 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SLC22A4Q9H015 551 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SLITRK2Q9H156 845 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SYT4Q9H2B2 425 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CHST11Q9NPF2 352 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RHBDL2Q9NX52 303 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 MED11Q9P086 117 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 PADI1Q9ULC6 663 aa9□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 LIPT2A6NK58 231 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM212A6NML5 194 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf98E9PRG8 122 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 MS4A18H0YCH9 400 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GMFGO60234 142 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HPGDSO60760 199 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ITGA10O75578 1167 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 UPK3AO75631 287 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 STK17BO94768 372 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TPPPO94811 219 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HRGP04196 525 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GNLYP22749 145 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NR4A2P43354 598 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 UQCRFS1P47985 274 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FOXF1Q12946 379 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 INSL4Q14641 139 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TEX30Q5JUR7 227 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 LIPNQ5VXI9 398 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RPTNQ6XPR3 784 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ESX1Q8N693 406 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OR2M3Q8NG83 312 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NTNG2Q96CW9 530 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SGCZQ96LD1 299 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TSSK2Q96PF2 358 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KCNJ15Q99712 375 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NEURL2Q9BR09 285 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SPTBP11277 2137 aa8.99□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0G2JK05 382 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FAM25AB3EWG3 89 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FAM25CB3EWG5 89 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 FAM25GB3EWG6 89 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 DCTN6O00399 190 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 SLC16A7O60669 478 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF254O75437 659 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 NCR1O76036 304 aa8.98□□□□□ -0.97
POLR1A-204ENST00000424089 AQP8O94778 261 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms