RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000057767.4

Upk1b-201, Transcript of Uroplakin-1b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Upk1b, Length 1,769 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Cox5bP19536 128 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 CpoxP36552 443 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 PtgirP43252 415 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Rps4xP62702 263 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 TsxP70675 144 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 2410002F23RikQ3TE80 284 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Shisa3Q3UPR0 238 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Nufip2Q5F2E7 692 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 2900092C05RikQ5I0V9 184 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Pla2g7Q60963 440 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Cd34Q64314 382 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Mettl27Q8BGM4 238 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Tnfsfm13Q8BXS2 410 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Fgd2Q8BY35 655 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Apoa5Q8C7G5 368 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 LiphQ8CIV3 451 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Aqp3Q8R2N1 292 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr821Q8VG45 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr1351Q8VGU6 319 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Clec2fQ8VI21 196 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Tmem218Q9CQ44 115 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Rbm18Q9CR83 190 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Hcfc1r1Q9CYQ5 120 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Mpc2Q9D023 127 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Gpn3Q9D3W4 284 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Ptp4a3Q9D658 173 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Lime1Q9EQR5 269 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Chst11Q9JME2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Eci2Q9WUR2 391 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Efemp2Q9WVJ9 443 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 DmdP11531 3678 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Gm13762A2ATG2 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r137D3YTY1 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 SelenonD3Z2R5 557 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r143E9PUW9 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Prdm13E9PZZ1 754 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r157E9Q069 297 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r139E9Q8L6 297 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Omt2aF6ZJR3 104 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r112G3UY48 297 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 OpcmlG5E8G3 345 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn2r99H3BK37 856 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Tmem200cJ3QK46 637 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r135K9J7G0 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr1221L7MU53 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr889L7N1Y6 314 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r125L7N227 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r116L7N2A6 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Tmem178bM0QWJ9 172 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Agtr1aP29754 359 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Uba1yP31254 1058 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Foxa1P35582 468 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Clec10aP49300 304 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Tas2r123P59528 333 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Rap2bP61226 183 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Rit1P70426 219 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Prss55Q14BX2 321 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Scand1Q2M4I6 142 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Lhfpl5Q4KL25 219 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r196Q5SVD5 301 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Kcnc3Q63959 769 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Inca1Q6PKN7 231 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Tha1Q6XPS7 400 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 P4htmQ8BG58 503 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 CyrenQ8BHZ5 157 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Nob1Q8BW10 403 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Gpr157Q8C206 330 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Pxdc1Q8JZU6 231 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Amdhd2Q8JZV7 409 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Pom121Q8K3Z9 1200 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Q8R2K8 148 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr165Q8VFA2 313 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr578Q8VH17 313 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 LsrQ99KG5 594 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Commd4Q9CQ02 199 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r100Q9EPS5 307 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Yipf7Q9JIM5 254 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 FastkQ9JIX9 511 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 SpastQ9QYY8 614 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Skp1Q9WTX5 163 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Bex2Q9WTZ8 129 aa9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Tnrc6aQ3UHK8 1896 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Gm9573F7C950 1606 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr1493-ps1A0A140LHU2 316 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr560A0A1B0GSU5 314 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Zfp300A2AE21 645 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Zfp735B1ARH2 734 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Fbxw28E9Q8A4 466 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Psg20E9Q9B4 475 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Gm21876F6XK35 94 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Rdh19G5E8H9 318 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Vmn1r115K7N6Y3 295 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Olfr741L7N1Y5 311 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Kcns1O35173 497 aa9.49□□□□□ -0.89
Upk1b-201ENSMUST00000057767 Crisp2P16563 243 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.3 ms