Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,81■■■■□ 3
Vmn1r196Q5SVD5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Vmn1r196Q5SVD5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Vmn1r196Q5SVD5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Vmn1r196Q5SVD5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Vmn1r196Q5SVD5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Vmn1r196Q5SVD5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Vmn1r196Q5SVD5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Vmn1r196Q5SVD5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Vmn1r196Q5SVD5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vmn1r196Q5SVD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Vmn1r196Q5SVD5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Vmn1r196Q5SVD5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Vmn1r196Q5SVD5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Vmn1r196Q5SVD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Vmn1r196Q5SVD5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Vmn1r196Q5SVD5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Vmn1r196Q5SVD5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Vmn1r196Q5SVD5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Vmn1r196Q5SVD5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Vmn1r196Q5SVD5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Vmn1r196Q5SVD5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Vmn1r196Q5SVD5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Vmn1r196Q5SVD5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Vmn1r196Q5SVD5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r196Q5SVD5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r196Q5SVD5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Vmn1r196Q5SVD5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vmn1r196Q5SVD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Vmn1r196Q5SVD5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Vmn1r196Q5SVD5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Vmn1r196Q5SVD5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vmn1r196Q5SVD5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Vmn1r196Q5SVD5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vmn1r196Q5SVD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Vmn1r196Q5SVD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Vmn1r196Q5SVD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Vmn1r196Q5SVD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Vmn1r196Q5SVD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r196Q5SVD5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Vmn1r196Q5SVD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Vmn1r196Q5SVD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Vmn1r196Q5SVD5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Vmn1r196Q5SVD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Vmn1r196Q5SVD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Vmn1r196Q5SVD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Vmn1r196Q5SVD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Vmn1r196Q5SVD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Vmn1r196Q5SVD5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Vmn1r196Q5SVD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Vmn1r196Q5SVD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Vmn1r196Q5SVD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Vmn1r196Q5SVD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Vmn1r196Q5SVD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Vmn1r196Q5SVD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Vmn1r196Q5SVD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms