RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624		A6NLC8	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PPM1D	O15297	605 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CTNS	O60931	367 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	GP1BA	P07359	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CHAT	P28329	748 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	GDI1	P31150	447 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SERPINF1	P36955	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624		A0A087WV62	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	MPIG6B	O95866	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ARG1	P05089	322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	NR2C1	P13056	603 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	NPBWR1	P48145	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CAV2	P51636	162 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	AGER	Q15109	404 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CDC6	Q99741	560 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CACNA1G	O43497	2377 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ABCD4	O14678	606 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PLPP2	O43688	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	F13B	P05160	661 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PI3	P19957	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ARL4D	P49703	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ZP1	P60852	638 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	NELFA	Q9H3P2	528 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624		A8MXK9	166 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	MB	P02144	154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	RPA2	P15927	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CRYBA2	P53672	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	OTP	Q5XKR4	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	AIFM1	O95831	613 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	RASL12	Q9NYN1	266 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PS29	197 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	KCNAB3	O43448	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	LRP3	O75074	770 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PXN-222	ENST00000637624	CD53	P19397	219 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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