RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CIB4	A0PJX0	185 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	URAD	A6NGE7	173 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	C17orf100	A8MU93	164 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MANBA	O00462	879 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TYROBP	O43914	113 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MGRN1	O60291	552 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM24	O75264	130 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CDH16	O75309	829 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	PGM3	O95394	542 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV3-9	P01782	118 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IFNW1	P05000	195 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	GSTA1	P08263	222 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MELTF	P08582	738 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CT62	P0C5K7	136 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF12	P17014	697 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IMPDH1	P20839	514 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	S1PR1	P21453	382 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ABCD3	P28288	659 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SLC1A3	P43003	542 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	RFX3	P48380	749 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CCNG1	P51959	295 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	HMGCS1	Q01581	520 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF154	Q13106	437 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CUL3	Q13618	768 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SERTAD2	Q14140	314 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	EFNB3	Q15768	340 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	MREG	Q8N565	214 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DYRK2	Q92630	601 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	RAB8B	Q92930	207 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf95	Q9H693	158 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0A0MQY5	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768		C9JVG2	144 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	TNFSF11	O14788	317 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	GMFG	O60234	142 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	UGT2B11	O75310	529 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	GLRA3	O75311	464 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SPAG7	O75391	227 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SUPT7L	O94864	414 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA3D	O95025	777 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	OTC	P00480	354 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	KLK1	P06870	262 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CHRNG	P07510	517 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	COX5A	P20674	150 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	CPN2	P22792	545 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	SERPINB1	P30740	379 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ALDH3A1	P30838	453 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	ARFIP1	P53367	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJB13	P59910	316 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LCP2	Q13094	533 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	LTB4R	Q15722	352 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MLH1-223	ENST00000616768	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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