RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 RPS6KA3P51812 740 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 IL1RL1Q01638 556 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 SELENBP1Q13228 472 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 ACER3Q9NUN7 267 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 MALT1Q9UDY8 824 aa13.16□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 SULT2B1O00204 365 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 PNPP00491 289 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 MYF6P23409 242 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 PRPS1P60891 318 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 QPRTQ15274 297 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 EFNB3Q15768 340 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 DUSP7Q16829 419 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 SLC36A3Q495N2 470 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 COMTD1Q86VU5 262 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 CCDC103Q8IW40 242 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 BPIFB2Q8N4F0 458 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM234Q8WY98 164 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 EPYCQ99645 322 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 DOK1Q99704 481 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 ARHGDIGQ99819 225 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 KCNS3Q9BQ31 491 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 SLC7A10Q9NS82 523 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 MED29Q9NX70 200 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 KIF17Q9P2E2 1029 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 UPB1Q9UBR1 384 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 MYRFQ9Y2G1 1151 aa13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
POLR2E-210ENST00000592597 CYP7B1O75881 506 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 IFNW1P05000 195 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 ALPLP05186 524 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 ADRA2AP08913 450 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 GAAP10253 952 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 COL8A2P25067 703 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 CALCRP30988 508 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SLC1A3P43003 542 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 CCR4P51679 360 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TUBA1BP68363 451 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TUBA4AP68366 448 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 IL18R1Q13478 541 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 CASP12Q6UXS9 341 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TMPPEQ6ZT21 453 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TUBA1AQ71U36 451 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 C1QL4Q86Z23 238 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 CDK20Q8IZL9 346 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SMYD1Q8NB12 490 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 OR51F2Q8NH61 342 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SLC38A2Q96QD8 506 aa13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM129A0AVI4 362 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 AP3D1O14617 1153 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 FMO6PO60774 539 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 WNT11O96014 354 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 CRYAAP02489 173 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 OPN1SWP03999 348 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SAGP10523 405 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 PRG2P13727 222 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 THBS4P35443 961 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 HTR3AP46098 478 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SMIM11AP58511 58 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TSPO2Q5TGU0 170 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 KLHL24Q6TFL4 600 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 LSMEM1Q8N8F7 131 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 RNF217Q8TC41 542 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 FAM192AQ9GZU8 254 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 DYNLRB1Q9NP97 96 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 NDUFA13Q9P0J0 144 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 ENOPH1Q9UHY7 261 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SLC13A4Q9UKG4 626 aa13.13□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TNFRSF11BO00300 401 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 GKN3PP0CG01 181 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 TFPIP10646 304 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 RHCEP18577 417 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 RYKP34925 604 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 IDH2P48735 452 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 MAP2K6P52564 334 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 NAAAQ02083 359 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 HGFACQ04756 655 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 GRINAQ7Z429 371 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 SETD9Q8NE22 299 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 C7orf34Q96L11 122 aa13.12□□□□□ -0.31
POLR2E-210ENST00000592597 WFDC6Q9BQY6 131 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms