RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590638.5

NEDD4L-230, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-230ENST00000590638 PGCP20142 388 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 F8A1P23610 371 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 GGT2P36268 569 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 OMPP47874 163 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 GSSP48637 474 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 CENPAP49450 140 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 SSR4P51571 173 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 CCR4P51679 360 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 NUP107P57740 925 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 FBXW4P57775 412 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 RAPSNQ13702 412 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 MED22Q15528 200 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 CBLN3Q6UW01 205 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 CADM3Q8N126 398 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 CADM2Q8N3J6 435 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 OR5W2Q8NH69 310 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF563Q8TA94 476 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 GRHL3Q8TE85 626 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM239Q8WW34 195 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 C12orf10Q9HB07 376 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 DECR2Q9NUI1 292 aa6.96□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.96□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 A6NNC1 897 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 USP17L23D6RBM5 183 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 H3BN98 237 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 SCO2O43819 266 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 MPZL2O60487 215 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 NUDT14O95848 222 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 IGF2P01344 180 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 CDC42P60953 191 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 ISL1P61371 349 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 MYBPC1Q00872 1141 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 IL5RAQ01344 420 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 ITGADQ13349 1161 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 MEP1AQ16819 746 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 NRMQ8IXM6 262 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF786Q8N393 782 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.95□□□□□ -1.3
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NEDD4L-230ENST00000590638 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM234Q8WY98 164 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.95□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD4L-230ENST00000590638 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.94□□□□□ -1.3
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