RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLRN1P58418 232 aa26■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MXD1Q05195 221 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTP5Q14D33 572 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 POU4F3Q15319 338 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF454Q8N9F8 522 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABHD4Q8TB40 342 aa26■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC35F4A4IF30 521 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF726A6NNF4 738 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNFSF11O14788 317 aa25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASB18Q6ZVZ8 466 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTYH2Q9BSA4 534 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF32Q9H0A6 362 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNG2Q9UJ96 466 aa25.98■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR8G3PP0DMU2 310 aa25.97■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF823P16415 610 aa25.97■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ACSM3Q53FZ2 586 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEACAM19Q7Z692 300 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEX19Q8NA77 164 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 AP3S1Q92572 193 aa25.95■■□□□ 1.74
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