RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 FUT1P19526 365 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM33P57088 247 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R41P59536 307 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RUNX1T1Q06455 604 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D28Q2M2D7 210 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NKAIN4Q8IVV8 208 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 OR1J2Q8NGS2 313 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 PFN4Q8NHR9 129 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM239Q8WW34 195 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF347Q96SE7 839 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ECSITQ9BQ95 431 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF416Q9BWM5 594 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 BCL2L14Q9BZR8 327 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SMURF2Q9HAU4 748 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP13Q9UII6 198 aa17.98■□□□□ 0.47
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LIMS1-208ENST00000428064 TFP02787 698 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 F13BP05160 661 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ACADSP16219 412 aa17.97■□□□□ 0.47
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LIMS1-208ENST00000428064 LIPNQ5VXI9 398 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF519Q8TB69 540 aa17.97■□□□□ 0.47
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LIMS1-208ENST00000428064 RNF121Q9H920 327 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 CDH20Q9HBT6 801 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 INIPQ9NRY2 104 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RIMS3Q9UJD0 308 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 FZR1Q9UM11 496 aa17.97■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 HTR3EA5X5Y0 456 aa17.96■□□□□ 0.47
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LIMS1-208ENST00000428064 RP2O75695 350 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NCR1O76036 304 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NAT2P11245 290 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NR2C1P13056 603 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 COL8A2P25067 703 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RAD52P43351 418 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 PLP2Q04941 152 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 CCNIQ14094 377 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MAPRE2Q15555 327 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NKPD1Q17RQ9 610 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 PCGF3Q3KNV8 242 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ARMC4Q5T2S8 1044 aa17.96■□□□□ 0.47
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LIMS1-208ENST00000428064 YIPF5Q969M3 257 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
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LIMS1-208ENST00000428064 LRMDAQ9H2I8 198 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf141Q9NUB4 165 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa17.96■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 GMNCA6NCL1 334 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf100A8MU93 164 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 MRASO14807 208 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 FAM157BP0CG42 384 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 SAGP10523 405 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF1BP20333 461 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 AQP2P41181 271 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 UCP2P55851 309 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 TAF11Q15544 211 aa17.95■□□□□ 0.46
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LIMS1-208ENST00000428064 C11orf40Q8WZ69 217 aa17.95■□□□□ 0.46
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LIMS1-208ENST00000428064 MED31Q9Y3C7 131 aa17.95■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 FAM220BPB1ANY3 271 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 TCF21O43680 179 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 CCL2P13500 99 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 MYBPC1Q00872 1141 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 KLF10Q13118 480 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 SYT14Q8NB59 555 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 SNX33Q8WV41 574 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf82Q8WW14 230 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 NABP1Q96AH0 204 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 TXNIPQ9H3M7 391 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 SAR1AQ9NR31 198 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa17.94■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 CLPTM1O96005 669 aa17.93■□□□□ 0.46
LIMS1-208ENST00000428064 IGHMP01871 453 aa17.93■□□□□ 0.46
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